文章目录

1 材料与方法

1.1 水稻几丁质酶基因家族成员的鉴定

1.2 水稻几丁质酶基因家族系统进化树、家族成员结构和保守结构域分析

1.3 水稻几丁质酶基因家族染色体定位和基因复制类型分析

1.4 水稻几丁质酶基因启动子区顺式作用元件分析

1.5 水稻几丁质酶基因在不同水稻器官/组织及胁迫下的表达模式分析

2 实验结果

2.1 水稻几丁质酶基因家族的鉴定和蛋白特征分析

2.2 水稻几丁质酶基因家族系统发育、结构特征和保守结构域分析

2.3 水稻几丁质酶基因家族的染色体定位和共线性分析

2.4 水稻几丁质酶家族基因启动子区顺式作用因子(cis-acting elements)分析

2.5 水稻几丁质酶基因家族在不同组织的表达模式

2.6 水稻几丁质酶基因家族在生物和非生物胁迫下的表达模式

3 讨论

文章摘要:几丁质酶是一种病程相关蛋白,不但在植物对病原菌和虫害的防御过程中发挥重要作用,也参与了植物对非生物胁迫的应答反应。然而,目前对几丁质酶在水稻应答各种生物和非生物胁迫的相关研究报道相对较少。利用BLASTP和隐马科夫模型（HMM）,在水稻基因组中鉴定了49个几丁质酶基因,其中33个几丁质酶基因属于GH18亚家族, 16个基因属于GH19亚家族,位于同一亚族的几丁质酶基因结构和保守基序组成相似。染色体定位分析表明,除了12号染色体以外,水稻几丁质酶基因不均匀地分布在剩下的11条染色体上。53.06%（26/49）的水稻几丁质酶基因发生了复制,其中包括4对片段重复基因和18个串联重复基因。通过RNA-seq数据分析水稻几丁质酶家族基因在不同器官/组织中的表达模式,发现水稻几丁质酶家族基因具有明显的组织特异性表达模式。此外,大部分的几丁质酶基因在叶和/或根中的表达至少受到一种胁迫因子的诱导。总的来说,水稻几丁质酶基因家族的综合分析将有助于进一步了解几丁质酶基因在水稻生长发育中的作用。

文章关键词:

论文作者:潘晓雪 胡明瑜 王忠伟 苏梅 雷开荣 吴红 蒋晓英 

论文DOI:10.13592/j.cnki.ppj.2021.0401

论文分类号:S511

文章来源：《中国水稻科学》 网址: http://www.zgsdkx.cn/qikandaodu/2022/0612/1247.html